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Identificación de elementos repetitivos en proyectos de secuenciación
La última década ha supuesto la entrada oficial en la era de las ómicas. Este sufijo, que deriva del griego -oma (¿¿¿), se aplica a ciertas palabras para indicar el estudio de las mismas en un conjunto o en la totalidad. De esta manera el estudio a gran escala de proteínas se llama proteómica; el de los metabolitos, metabolómica; el de los genomas genómica, etc. Esta última, la genómica, es la que probablemente ha avanzado más debido a la aparición de secuenciadores de nueva generación, que han permitido un abaratamiento considerable de los costes de secuenciación (Figura 1). Pero contrariamente a la secuenciación de Sanger, que genera secuencias alrededor de 800-1000 pares de bases (pb) aunque limitadas en número, las nuevas técnicas de secuenciación (NGS) generan millones de fragmentos pero más cortos, de 50-250 pb, lo que provoca un desafío técnico a la hora de lidiar con el ADN repetitivo. Aunque haya diferentes tipos y complejidades, los elementos repetitivos que más problemas
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